1、IO.SYS的内部启动菜单
Win 9X的IO.SYS由原DOS的系统文件IO.SYS、MSDOS.SYS合并而成，提供标准硬件的输入/输出接口和DOS的中断调 用，功能全面增强，它基本上控制着Win 9X的全部启动过程，是Windows的DOS实模式的核心文件。但它需要根据MSDOS.SYS的设置才能实 现正常的启动过程。
IO.SYS可由启动功能键改变启动过程，这些功能键对应着启动菜单各选项：功能键
对应的启动菜单项 F4：
Previous MS-DOS version F5：
Safe mode Shift+F5： Command prompt only F6：
Safe mode with network support F8：
启动时调出启动菜单 Shift+F8： Step-by-step confirmation 系统启动出现“Starting Windows 95...”时按下功能键即可
IO.SYS提供启动选择菜单，便于用户根据需要选择启动方式：
⑴Normal
正常启动模式(默认的启动方式)
当MSDOS.SYS中的BootWin=0时，选择本项系统将启动旧版DOS
⑵Logged(BOOTLOG.TXT)
正常启动模式，同时在根目录下形成BOOTLOG.TXT
BOOTLOG.TXT记录了启动过程中发生的所有情况，是Win 9X系统启动过程唯一全面的诊断记录，可供用户检查启动过程中的问题
⑶Safe mode
安全模式的GUI，屏幕四角有“安全模式”字样不加载CONFIG.SYS、AUTOEXEC.BAT，也不加载启动程序组中任何程序，只加载最基本硬 件配置 (标准VGA模式，无声卡、光驱等)，即最简单的GUI启动，用于纠正因硬件配置等造成的GUI启动问题。系统出现问题无法正常启动时，多数情况 下会进入该启动模式，但该模式能解决的问题非常有限，多用于显示器等配置系统配置主要在控制面板上调整。要进入正常的GUI，必须重新启动
⑷Step-by-step confirmation
单步执行 Windows启动
用于确定因系统文件损坏造成的启动故障，该方式仅能确定DOS启动过程中的系统问题，主要修正Config.sys和Autoexec.bat中存在的问题要确定GUI启动过程中的问题，只能借助BOOTLOG.TXT文件
⑸Command prompt only
仅执行完整的实模式 DOS启动过程，进入纯DOS状态加载全部支持Win启动的DOS驱动程序，主要用于只能运行于纯DOS模式下的应用软件或解决严重的系统问题，可用命令Win启动正常的GUI
⑹Safe mode command prompt only最简单的 DOS启动仅执行最基本的IO.SYS、MSDOS.SYS和 COMMAND.COM三个系统文件，不加载默认驱动程序(HIMEM.SYS、IFSHLP.EXE和SETVER.EXE)和CONFIG.SYS， AUTOEXEC.BAT，其它的环境默认值同Win 9X 的设定，该模式无法继续启动正常的或安全模式的GUI，主要用于处理最严重的系统故障。
⑺Previous MS-DOS version
启动旧版DOS，执行双重启动根目录下应有以.DOS为扩展名保存的五个原DOS系统文件。该选项的出现由MSDOS.SYS中的参数 “BootMulti”控制注意：当MSDOS.SYS中的BootWin=0时，选择本项将启动正常的Win 9X系统 ⑻Safe mode with network support带实模式网络访问的安全模式该选项的出现由MSDOS.SYS中的参数 “NetWork”控制用于排除网络系统的PC故障，可通过实模式网络系统，获得更大的系统支持
2、IO.SYS提供的扩展的DOS默认配置
IO.SYS在启动时与DOS的最大不同，是提供能满足大多数DOS应用的缺省CONFIG.SYS配置，能够自动加载必要的驱动程序，以保证Win 9X正常启动，具体内容如下：
HIMEM.SYS
：支持1M以上内存，提供扩展内存(XMS)管理保证Win启动的必需文件
DBLBUFF.SYS
：双重缓存驱动程序，仅需要时加载，多用于支持SCSI卡
IFSHLP.EXE
：增强的文件管理驱动程序，支持Win的VFAT系统保证Win启动的必需文件
SETVER.EXE
：版本登录服务，消除版本限制，仅在DOS下用
Dblspace.bin
：DOS 6.0磁盘压缩驱动程序，仅在硬盘被压缩时才加载
Drvspace.bin
：DOS 6.22以后的磁盘压缩驱动程序，同上
DOS＝HIGH,UMB
：将DOS系统移入HMA，以留出更多的常规内存而UMB对系统没有任何作用，实属摆设
FILES＝30
：能打开的最大文件数，能满足大多数应用仅为DOS下使用，Win 9X不需要
BUFFERS＝30
：设置最大的磁盘缓冲区数，能满足大多数应用仅为DOS使用，Win 9X不需要
FCBS＝4
：文件控制块数，现已极少使用，仅为DOS使用
LASTDRIVE＝Z
：最大盘符设置，该值设置过小，将无法加载光驱
STACKS＝9,256
：设定栈数目、大小，该设置为旧程序使用Win 9X系统不需要
SHELL＝COMMAND.COM/P   ：指定Win 9X命令行处理程序
IO.SYS提供的系统环境设置如下：
命令查寻路径 ： PATH=C:\Windows;C:\Windows\COMMAND
DOS提示符 ： PROMPT=$P$G
临时文件目录 ： TEMP=TMP=C:\Windows\TEMP
命令行处理程序位置：COMSEPC=C:\Windows\COMMAND\COMMAND.COM
IO.SYS提供了较完善的系统配置，使取消CONFIG.SYS、AUTOEXEC.BAT成为可能。出于兼容性考虑，IO.SYS不加载 EMM386.EXE驱动，不提供扩充内存EMS和上位内存UMB。EMM386.EXE在系统搜寻新硬件时可能引起系统死机，在日常使用时不会有问题。
3、IO.SYS控制下的启动过程
⑴系统启动时，IO.SYS显示“Starting Windows 95...”，此时可由启动功能键选择启动方式。
⑵IO.SYS根据启动菜单选择和MSDOS.SYS的配置确定启动模式。
⑶若使用原DOS系统，IO.SYS自动将DOS和Win 9X的系统启动文件对换，然后由原DOS控制系统启动过程。(即Win 9X的双重启动过程最终是由IO.SYS控制完成的，与引导记录等无关)
⑷IO.SYS根据启动模式先由CONFIG.SYS进行系统硬件配置，若CONFIG.SYS中没有加载Win 9X启动的必需文件(如 HIMEM.SYS、IFSHLP.EXE等)，系统则根据默认设置自动加载。(如果要加载使用扩展内存的驱动程序，如EMM386.EXE等，必须在 CONFIG.SYS第一行加上HIMEM.SYS驱动，否则由于系统此时未提供扩展内存，EMM386.EXE等程序将无法运行)
⑸完成CONFIG.SYS等硬件配置后，IO.SYS通过COMMAND.COM调用AUTOEXEC.BAT进行软件配置。
⑹系统根目录下的BOOTLOG.TXT是由IO.SYS控制完成的，其它一些日志文件多是在安装系统时建立的。
⑺完成DOS启动过程后自动调用Win.COM，开始启动GUI。